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资源介绍

本课程内容包含生物信息基础,Linux基本操作,生物软件安装,生物数据下载,宏基因组数据分析,R语言零基础入门,R语言数据分析,R语言绘图,R语言高级技能,RNAseq数据分析,单细胞数据分析,基因组数据分析等等内容。

资源目录

01生物信息入门

02Linux基础

03生物软件及数据库

04illumina测序原理及数据处理

05pacbio测序原理及数据处理

06nanopore测序原理及数据处理

07解决软件报错

08新冠病毒数据分析

09构建系统发育树

10二代基因组拼接

11拼接结果统计及评估

12基因组拼接探索

13三代测序基因组拼接

14基因组序列分析

15序列比对

16共线性分析

17基因家族分析

18测序数据比对

19sam和bam文件处理

20Linux高级操作

21表格处理

22shell编程

23生物信息分析服务器简介

24生物信息分析平台搭建

25ubuntu系统配置

26R语言基础入门

27R数据结构

28R数据处理

29R统计检验

30R统计建模

31R基础绘图

32ggplot2绘图

33基因表达调控简介

34RNAseq概述

35RNAseq分析

36利用R分析RNAseq数据

37差异表达基因注释以及富集分析

38单细胞测序概述

39单细胞测序数据分析

40利用Seurat分析单细胞数据

43空间转录组

44宏基因组简介

45宏基因组分析环境搭建

46三代nanopore测序宏基因组数据分析

47临床病原微生物检测

48二代宏基因组测序数据分析

49宏基因组分析结果可视化

50二代宏基因组拼接

51三代纳米孔宏基因组拼接

52宏基因组功能分析

53metawrap分箱

54扩增子分析简介

55利用qime2分析16S数据

56利用R分析16S数据

57人基因变异检测

58人基因组数据分析环境搭建

59二代测序变异检测

60三代纳米孔变异检测

61igv变异可视化

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